1 Introduction to oral microbiology 

Commensals and pathogens 

Oral diseases 

2 In the beginning 

The first microbes 

Microbial basis of infectious disease 

Miller and the chemoparasitic theory of caries 

Oral and dental research 

3 Caries as an infectious disease 

Dental caries as a transmissible disease 

Streptococcus mutans 

Mutans group streptococci 

Link between S. mutans and dental caries 

Immunity to caries 

4 General properties of saliva 

Saliva production 

Protective role of saliva 

Salivary pellicle 

Saliva as a nutrient 

5 Salivary mucins and agglutinins 

Composition of mucins 

Properties of mucins 

Bacterial agglutination 

6 Secretory Immunoglobulin A 

Production of S-IgA 

Functions of S-IgA 

Inactivation of salivary defenses 

Development of S-IgA 

The window of infectivity 

Selective IgA deficiency 

7 Anti-microbial properties of saliva 

Anti-microbial components in saliva 

8 Innate defences 

Anti-microbial peptides (AMPs) 

Human AMPs 

9 Microbes in the oral cavity 

Primary colonizers 

Beneficial effects of bacterial colonizers 

Ecological plaque hypothesis 

Ecology and disease 

10 Molecular microbial taxonomy 

Molecular taxonomy 

Discontinuous gradient gel electrophoresis 

DNA chips 

11 Systems approaches to oral microbiology 

Transcriptomics 

Proteomics 

Gene ontology 

Post-translational networks 

Tiled arrays 

12 Oral streptococci 

The genus Streptococcus 

Viridans streptococci 

Lancefield grouping 

Relatedness and pathogenicity of streptococci 

13 Microbial adherence 

Adherence 

Long-range adherence 

Specific adhesion 

Oral bacterial adhesins and receptors 

14 Complex communities 

Inter-microbial reactions 

Co-adhesion 

Metabolic associations 

Antagonism 

15 Biofilms 

Biofilm development 

Microbial recognition of surfaces and interbacterial communication 

The biofilm matrix, resilience and resistance 

16 Bacterial polysaccharides 

Extracellular polysaccharide production 

Glycosyltransferases and fructosyltransferases 

Glucan binding proteins 

EPS produced by oral Gram-negatives 

17 Microbiology of caries 

Structure of teeth 

Dental caries 

Types of dental caries 

Important bacteria in caries 

Emerging and polymicrobial pathogens 

18 Virulence factors of S. mutans 

Initial attachment to tooth surfaces 

Polysaccharide production 

Acid production 

Acid tolerance 

Biofilm adaptation 

19 Host and environmental factors in caries 

Host factors 

Dietary factors 

Caries risk assessment 

20 Fluoride 

Modes of action of fluoride 

Strategies for fluoride delivery 

Anti-microbial effects of fluoride 

Enhancing anti-microbial effects 

21 Anti-caries strategies 

Inhibitors 

Probiotics 

Immunization 

Vaccination 

22 Periodontal diseases 

Classification of periodontal diseases 

Role of plaque bacteria in periodontal diseases 

Role of host factors in periodontal diseases 

23 Microorganisms associated with periodontal diseases 

Gingivitis 

Chronic periodontitis 

Localized aggressive periodontitis 

Generalized aggressive periodontitis 

Color-coded complexes 

P. gingivalis, a consensus pathogen 

A. actinomycetemcomitans, a pathogen in LAP 

Culture independent bacterial detection 

24 Colonization by periodontal bacteria 

Adhesion 

Periodontal bacterial adhesins 

Intracellular invasion 

Mechanisms of invasion 

Host responses to intracellular bacteria 

25 Virulence factors of periodontal bacteria 

Toxins 

Proteolytic enzymes 

Bacterial components that impact alveolar bone 

Other toxic products 

26 The immune response and periodontal bacteria 

Importance of neutrophils 

Innate immune sensing of periodontal bacteria 

Tissue destruction and bone loss 

Genetic factors associated with periodontal disease 

27 Relationship between periodontal diseases and systemic health 

Pathogenic mechanisms – general principles 

Cardiovascular disease (CVD) 

Adverse pregnancy outcomes 

Pulmonary infections 

Diabetes 

Osteoporosis 

28 Implants and titanium 

Osseo-integration 

Implant structure 

Peri-implantitis 

Bacteria associated with peri-implantitis 

Asepsis and treatment 

29 Endodontic infections 

Dentinal tubules 

Bacterial invasion of dentin 

Microbiota of endodontic infections 

Symptomatic versus asymptomatic 

Treatment 

30 Host factors in endodontic infections 

Pulpal infections 

Periapical abscesses 

Repair and angiogenesis 

Resistant bacteria 

31 Infective endocarditis 

Bacteria in IE 

Mechanism of vegetation formation 

Bacterial virulence factors 

Antibiotics in IE 

32 Oral mucosal, bone and systemic infections 

Mucosal infections 

Submucosal and bone infections 

Oral manifestations of systemic infections 

Systemic manifestations of oral infections 

33 Candida albicans and fungal infections 

C. albicans infections 

Denture stomatitis 

Angular cheilitis 

Gingivitis and periodontal disease 

Prosthetic implants 

Biofilms and antifungal drugs 

34 Oral virology I, herpes, papillomavirus and parvovirus 

Herpes viruses 

Papillomaviruses 

Parvoviruses 

35 Oral virology II, hepatitis and HIV 

Hepatitis B virus (HBV) 

Hepatitis D virus (HDV, delta agent) 

Other hepatitis viruses 

Human immunodeficiency virus (HIV) 

36 Antibiotics and antibiotic resistance 

Antibiotics in dentistry 

Resistance to anti-microbial agents 

Transfer of anti-microbial resistance 

Curtailing anti-microbial resistance 

37 Sterilization 

Heat 

Radiation 

Chemicals 

38 Disinfection 

Physical 

Chemical 

39 Infection control 

Prions 

Dental unit water lines (DUWL) 

40 Bioterrorism 

Anthrax 

Botulism 

Smallpox 

Salmonella 

Biological weapons convention